Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIF2

Rbfox3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbfox3Q8BIF2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbfox3Q8BIF2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms