Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFQ9

Klhl42, Kelch-like protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl42Q8BFQ9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl42Q8BFQ9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klhl42Q8BFQ9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klhl42Q8BFQ9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klhl42Q8BFQ9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klhl42Q8BFQ9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klhl42Q8BFQ9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl42Q8BFQ9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl42Q8BFQ9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl42Q8BFQ9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl42Q8BFQ9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl42Q8BFQ9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl42Q8BFQ9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl42Q8BFQ9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl42Q8BFQ9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl42Q8BFQ9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl42Q8BFQ9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl42Q8BFQ9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl42Q8BFQ9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl42Q8BFQ9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl42Q8BFQ9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl42Q8BFQ9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl42Q8BFQ9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl42Q8BFQ9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl42Q8BFQ9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl42Q8BFQ9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl42Q8BFQ9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl42Q8BFQ9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms