Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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H2-M10.4Q85ZW8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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H2-M10.4Q85ZW8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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H2-M10.4Q85ZW8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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H2-M10.4Q85ZW8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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H2-M10.4Q85ZW8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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H2-M10.4Q85ZW8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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H2-M10.4Q85ZW8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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H2-M10.4Q85ZW8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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H2-M10.4Q85ZW8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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H2-M10.4Q85ZW8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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H2-M10.4Q85ZW8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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H2-M10.4Q85ZW8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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H2-M10.4Q85ZW8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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H2-M10.4Q85ZW8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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H2-M10.4Q85ZW8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M10.4Q85ZW8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M10.4Q85ZW8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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H2-M10.4Q85ZW8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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H2-M10.4Q85ZW8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M10.4Q85ZW8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M10.4Q85ZW8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M10.4Q85ZW8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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