Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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