Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfap2eQ6VUP9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms