Protein–RNA interactions for Protein: Q6V4S5

Sdk2, Protein sidekick-2, mousemouse

Predictions only

Length 2,176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdk2Q6V4S5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdk2Q6V4S5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdk2Q6V4S5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdk2Q6V4S5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdk2Q6V4S5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdk2Q6V4S5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdk2Q6V4S5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdk2Q6V4S5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdk2Q6V4S5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdk2Q6V4S5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdk2Q6V4S5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdk2Q6V4S5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdk2Q6V4S5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdk2Q6V4S5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdk2Q6V4S5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdk2Q6V4S5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdk2Q6V4S5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdk2Q6V4S5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdk2Q6V4S5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdk2Q6V4S5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdk2Q6V4S5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdk2Q6V4S5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdk2Q6V4S5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms