Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg16l2Q6KAU8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms