Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3ipQ68EF0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3ipQ68EF0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms