Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp1Q62442 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp1Q62442 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms