Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prg2Q61878 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prg2Q61878 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prg2Q61878 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prg2Q61878 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Prg2Q61878 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prg2Q61878 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prg2Q61878 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prg2Q61878 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prg2Q61878 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prg2Q61878 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prg2Q61878 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Prg2Q61878 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prg2Q61878 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prg2Q61878 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prg2Q61878 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prg2Q61878 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prg2Q61878 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prg2Q61878 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prg2Q61878 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prg2Q61878 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms