Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd47Q61735 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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