Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlha9Q5RJB0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms