Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Trdv4Q5R1A3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Trdv4Q5R1A3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trdv4Q5R1A3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trdv4Q5R1A3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trdv4Q5R1A3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trdv4Q5R1A3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trdv4Q5R1A3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trdv4Q5R1A3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trdv4Q5R1A3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trdv4Q5R1A3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trdv4Q5R1A3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trdv4Q5R1A3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trdv4Q5R1A3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Trdv4Q5R1A3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trdv4Q5R1A3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trdv4Q5R1A3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trdv4Q5R1A3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trdv4Q5R1A3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trdv4Q5R1A3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trdv4Q5R1A3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trdv4Q5R1A3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trdv4Q5R1A3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trdv4Q5R1A3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trdv4Q5R1A3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trdv4Q5R1A3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trdv4Q5R1A3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trdv4Q5R1A3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trdv4Q5R1A3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trdv4Q5R1A3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trdv4Q5R1A3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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