Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spire1Q52KF3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms