Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Trp53i11Q4QQM4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Trp53i11Q4QQM4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trp53i11Q4QQM4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trp53i11Q4QQM4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trp53i11Q4QQM4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trp53i11Q4QQM4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trp53i11Q4QQM4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trp53i11Q4QQM4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trp53i11Q4QQM4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trp53i11Q4QQM4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trp53i11Q4QQM4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trp53i11Q4QQM4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trp53i11Q4QQM4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trp53i11Q4QQM4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trp53i11Q4QQM4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trp53i11Q4QQM4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trp53i11Q4QQM4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trp53i11Q4QQM4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trp53i11Q4QQM4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trp53i11Q4QQM4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trp53i11Q4QQM4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trp53i11Q4QQM4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trp53i11Q4QQM4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trp53i11Q4QQM4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trp53i11Q4QQM4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trp53i11Q4QQM4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trp53i11Q4QQM4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trp53i11Q4QQM4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trp53i11Q4QQM4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trp53i11Q4QQM4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trp53i11Q4QQM4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trp53i11Q4QQM4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trp53i11Q4QQM4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trp53i11Q4QQM4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trp53i11Q4QQM4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trp53i11Q4QQM4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trp53i11Q4QQM4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trp53i11Q4QQM4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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