Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc160Q3UYG1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms