Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWZ0

Trim75, Tripartite motif-containing protein 75, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim75Q3UWZ0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim75Q3UWZ0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim75Q3UWZ0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim75Q3UWZ0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim75Q3UWZ0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim75Q3UWZ0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim75Q3UWZ0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim75Q3UWZ0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim75Q3UWZ0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim75Q3UWZ0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim75Q3UWZ0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim75Q3UWZ0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim75Q3UWZ0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim75Q3UWZ0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim75Q3UWZ0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim75Q3UWZ0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim75Q3UWZ0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim75Q3UWZ0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim75Q3UWZ0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms