Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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