Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms