Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms