Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX3

Smyd5, SET and MYND domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd5Q3TYX3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smyd5Q3TYX3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Smyd5Q3TYX3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Smyd5Q3TYX3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Smyd5Q3TYX3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Smyd5Q3TYX3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Smyd5Q3TYX3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd5Q3TYX3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd5Q3TYX3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd5Q3TYX3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd5Q3TYX3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd5Q3TYX3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd5Q3TYX3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd5Q3TYX3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd5Q3TYX3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd5Q3TYX3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd5Q3TYX3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd5Q3TYX3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd5Q3TYX3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd5Q3TYX3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd5Q3TYX3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd5Q3TYX3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd5Q3TYX3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd5Q3TYX3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd5Q3TYX3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd5Q3TYX3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd5Q3TYX3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd5Q3TYX3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd5Q3TYX3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd5Q3TYX3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd5Q3TYX3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smyd5Q3TYX3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd5Q3TYX3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd5Q3TYX3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd5Q3TYX3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd5Q3TYX3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd5Q3TYX3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd5Q3TYX3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd5Q3TYX3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd5Q3TYX3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd5Q3TYX3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd5Q3TYX3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd5Q3TYX3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd5Q3TYX3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd5Q3TYX3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd5Q3TYX3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd5Q3TYX3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd5Q3TYX3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd5Q3TYX3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smyd5Q3TYX3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms