Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
InipQ3TXT3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
InipQ3TXT3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms