Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam107bQ3TGF2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms