Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms