Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL1

Tigd2, Tigger transposable element-derived protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd2Q0VBL1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tigd2Q0VBL1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms