Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab42Q0PD08 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms