Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tgm3Q08189 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms