Protein–RNA interactions for Protein: Q02257

Jup, Junction plakoglobin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JupQ02257 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
JupQ02257 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
JupQ02257 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JupQ02257 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JupQ02257 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JupQ02257 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JupQ02257 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JupQ02257 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JupQ02257 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
JupQ02257 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JupQ02257 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JupQ02257 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JupQ02257 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
JupQ02257 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JupQ02257 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JupQ02257 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JupQ02257 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JupQ02257 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JupQ02257 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JupQ02257 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JupQ02257 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JupQ02257 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JupQ02257 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JupQ02257 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JupQ02257 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JupQ02257 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
JupQ02257 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
JupQ02257 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
JupQ02257 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
JupQ02257 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
JupQ02257 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JupQ02257 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JupQ02257 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JupQ02257 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JupQ02257 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JupQ02257 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JupQ02257 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JupQ02257 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JupQ02257 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JupQ02257 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JupQ02257 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
JupQ02257 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JupQ02257 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
JupQ02257 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JupQ02257 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JupQ02257 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
JupQ02257 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
JupQ02257 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
JupQ02257 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JupQ02257 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JupQ02257 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JupQ02257 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JupQ02257 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JupQ02257 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JupQ02257 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JupQ02257 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JupQ02257 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JupQ02257 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JupQ02257 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JupQ02257 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JupQ02257 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JupQ02257 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JupQ02257 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JupQ02257 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JupQ02257 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JupQ02257 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JupQ02257 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JupQ02257 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JupQ02257 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JupQ02257 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JupQ02257 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
JupQ02257 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JupQ02257 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
JupQ02257 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JupQ02257 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
JupQ02257 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JupQ02257 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JupQ02257 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JupQ02257 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JupQ02257 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JupQ02257 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JupQ02257 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JupQ02257 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JupQ02257 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JupQ02257 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JupQ02257 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JupQ02257 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JupQ02257 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JupQ02257 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JupQ02257 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JupQ02257 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JupQ02257 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JupQ02257 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JupQ02257 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
JupQ02257 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JupQ02257 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JupQ02257 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JupQ02257 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
JupQ02257 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
JupQ02257 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms