Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms