Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gja5Q01231 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gja5Q01231 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gja5Q01231 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gja5Q01231 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gja5Q01231 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gja5Q01231 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gja5Q01231 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gja5Q01231 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gja5Q01231 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gja5Q01231 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gja5Q01231 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gja5Q01231 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gja5Q01231 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gja5Q01231 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gja5Q01231 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gja5Q01231 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gja5Q01231 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gja5Q01231 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gja5Q01231 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gja5Q01231 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gja5Q01231 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gja5Q01231 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gja5Q01231 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gja5Q01231 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gja5Q01231 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gja5Q01231 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gja5Q01231 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gja5Q01231 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gja5Q01231 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gja5Q01231 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gja5Q01231 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms