Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 594 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas1P97459 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas1P97459 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas1P97459 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Npas1P97459 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Npas1P97459 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Npas1P97459 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Npas1P97459 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Npas1P97459 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Npas1P97459 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Npas1P97459 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Npas1P97459 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Npas1P97459 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Npas1P97459 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Npas1P97459 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Npas1P97459 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Npas1P97459 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Npas1P97459 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Npas1P97459 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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