Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubg1P83887 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms