Protein–RNA interactions for Protein: P82350

Sgca, Alpha-sarcoglycan, mousemouse

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcaP82350 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcaP82350 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgcaP82350 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcaP82350 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SgcaP82350 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcaP82350 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgcaP82350 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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