Protein–RNA interactions for Protein: P70426

Rit1, GTP-binding protein Rit1, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rit1P70426 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rit1P70426 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rit1P70426 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rit1P70426 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rit1P70426 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rit1P70426 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms