Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp9xP70398 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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