Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rps28P62858 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps28P62858 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps28P62858 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps28P62858 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps28P62858 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps28P62858 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rps28P62858 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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