Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab1AP62821 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab1AP62821 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms