Protein–RNA interactions for Protein: P62317

Snrpd2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd2P62317 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snrpd2P62317 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms