Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abce1P61222 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abce1P61222 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abce1P61222 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abce1P61222 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abce1P61222 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abce1P61222 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abce1P61222 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abce1P61222 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abce1P61222 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abce1P61222 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abce1P61222 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abce1P61222 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abce1P61222 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abce1P61222 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abce1P61222 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abce1P61222 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abce1P61222 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abce1P61222 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abce1P61222 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abce1P61222 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abce1P61222 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abce1P61222 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abce1P61222 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abce1P61222 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abce1P61222 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abce1P61222 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abce1P61222 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abce1P61222 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abce1P61222 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abce1P61222 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abce1P61222 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abce1P61222 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abce1P61222 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abce1P61222 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms