Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfia3P60469 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppfia3P60469 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms