Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5eP56382 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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