Protein–RNA interactions for Protein: P55258

Rab8a, Ras-related protein Rab-8A, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8aP55258 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab8aP55258 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms