Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtpreP49446 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtpreP49446 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtpreP49446 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtpreP49446 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtpreP49446 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtpreP49446 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms