Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gbx2P48031 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms