Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax7P47239 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax7P47239 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax7P47239 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax7P47239 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax7P47239 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax7P47239 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax7P47239 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax7P47239 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax7P47239 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax7P47239 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax7P47239 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pax7P47239 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms