Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab11bP46638 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms