Protein–RNA interactions for Protein: P40336

Vps26a, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps26aP40336 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps26aP40336 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps26aP40336 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps26aP40336 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps26aP40336 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps26aP40336 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps26aP40336 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps26aP40336 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps26aP40336 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps26aP40336 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps26aP40336 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps26aP40336 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps26aP40336 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps26aP40336 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps26aP40336 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps26aP40336 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps26aP40336 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps26aP40336 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps26aP40336 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps26aP40336 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps26aP40336 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps26aP40336 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps26aP40336 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps26aP40336 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps26aP40336 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps26aP40336 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps26aP40336 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps26aP40336 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps26aP40336 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps26aP40336 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps26aP40336 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps26aP40336 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps26aP40336 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps26aP40336 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vps26aP40336 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vps26aP40336 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vps26aP40336 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vps26aP40336 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vps26aP40336 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vps26aP40336 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vps26aP40336 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vps26aP40336 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vps26aP40336 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vps26aP40336 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps26aP40336 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms