Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tfap2aP34056 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tfap2aP34056 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tfap2aP34056 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tfap2aP34056 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tfap2aP34056 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tfap2aP34056 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.1 ms