Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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Hoxd10P28359 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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Hoxd10P28359 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hoxd10P28359 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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