Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ChgaP26339 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ChgaP26339 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ChgaP26339 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ChgaP26339 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ChgaP26339 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ChgaP26339 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ChgaP26339 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ChgaP26339 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ChgaP26339 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ChgaP26339 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ChgaP26339 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ChgaP26339 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ChgaP26339 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ChgaP26339 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ChgaP26339 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ChgaP26339 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ChgaP26339 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ChgaP26339 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ChgaP26339 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ChgaP26339 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChgaP26339 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChgaP26339 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ChgaP26339 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms